出口企业在申请开具《来料加工免税证明》时，如提供的加工费增值税普通发票不是由加工贸易手(账)册上注明的加工单位开具的，主管税务机关应要求出口企业提供书面说明理由及主管海关出具的书面证明，否则不得申请开具《来料加工免税证明》，相应的加工费不得申报免税。
依据：
国家税务总局关于出口货物劳务增值税和消费税有关问题的公告
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