土地增值税清算以工程规划许可证上的分期项目为清算单位吗？

土地增值税以国家有关部门审批的房地产开发项目为单位进行清算，对于分期开发的项目，以分期项目为单位清算。开发项目中同时包含普通住宅和非普通住宅的，应分别计算增值额。

依据：
国家税务总局关于房地产开发企业土地增值税清算管理有关问题的通知