一、适用税率的审核
审核企业所得税适用税率是否正确，适用税率与年度纳税申报表中的税率(即法定税率)不同，年度纳税申报表中的税率均为25%,而适用税率指享受定期减免税优惠政策的企业适用的税率，如高新技术企业为15%,软件企业免税期间为0。
二、减免税的审核
审核符合享受减免税条件的企业是否充分运用了优惠政策。根据税法规定，企业的下列支出，可以在计算应纳税所得额时加计扣除，开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用;安置残疾人员及国家鼓励安置的其他就业人员所支付的工资。此外,创业投资企业从事国家需要重点扶持和鼓励的创业投资，可以按投资额的一定比例抵扣应纳税所得额。企业的固定资产由于技术进步等原因，确需加速折旧的，可以缩短折旧年限或者采取加速折旧的方法。企业综合利用资源，生产符合国家产业政策规定的产品所取得的收入，可以在计算应纳税所得额时减计收入。企业购置用于环境保护、节能节水、安全生产等
专用设备的投资额，可以按一定比例实行税额抵免。审核人员在检查时，应注意企业对于减免税政策运用得是否正确，是否存在应该享受的优惠，由于企业的原因，没有足额享受,而不应享受的优惠又超范围超标准享受的情况。
1、审核企业已享受的优惠政策是否根据政策要求留存相应的备查资料。
2、审核企业享受减免的金额计算是否正确。
审核时，第一，应通过询问，对照税收优惠政策，看看该企业应享受哪些政策;第二，审核企业所得税纳税申报表,看看企业已享受了哪些优惠政策;第三，对申报表上已享受的减免税项目，应审核税务部门的相关文件;第四，对所得税申报表上的减免税不符合规定的应予以剔除，对企业应该享受而未享受的减免税,帮助企业尽快享受。
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