纳税人收到退税款项的当月，应将退税额从增值税进项税额中转出。
纳税人应在收到税务机关准予留抵退税的《税务事项通知书》当期，以税务机关核准的允许退还的增量留抵税额冲减期末留抵税额，并在办理增值税纳税申报时，相应填写《增值税纳税申报表附列资料（二）（本期进项税额明细）》第22栏“上期留抵税额退税”。
依据：
国家税务总局关于办理增值税期末留抵税额退税有关事项的公告
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