一、运输企业在退税申报期内，凭下列资料及电子数据向主管税务机关申请办理船舶退税：
（一）财税〔2020〕41号文件第三条第1项、第2项规定的资料复印件，或者财税〔2020〕52号文件第三条第1项、第2项规定的资料复印件。其中，已向主管税务机关提供过的资料，如无变化，可不再重复提供。
（二）《购进自用货物退税申报表》及其电子数据。该表在《国家税务总局关于发布〈出口货物劳务增值税和消费税管理办法〉的公告》（2012年第24号）发布。填写该表时，应在业务类型栏填写“CBTS”,备注栏填写“船舶退税”。
（三）境内建造船舶企业开具的增值税专用发票及其电子信息。
（四）主管税务机关要求提供的其他资料。 上述增值税专用发票，应当已通过增值税发票综合服务平台确认用途为“用于出口退税”。上述资料运输企业可通过电子化方式提交。
二、财税〔2020〕41号文件第三条规定如下： 购进船舶的运输企业向主管税务机关申请退税时应提供以下资料：
1、船舶登记管理部门出具的表明船籍港为“中国洋浦港”的《船舶所有权登记证书》。
2、运输企业及购进船舶从事国际运输和港澳台运输业务的证明文件。从事国际散装液体危险货物和旅客运输的，应提交有效的《国际船舶运输经营许可证》和《国际海上运输船舶备案证明书》，从事国际集装箱和普通货物运输的，应提交有效的交通运输管理部门备案证明材料;从事内地往返港澳散装液体危险货物和普通货物运输的，应提交有效的交通运输管理部门备案证明材料;从事大陆与台湾地区间运输的，应提交有效的《台湾海峡两岸间水路运输许可证》和《台湾海峡两岸间船舶营运证》。
3、主管税务机关要求提供的其他材料。
本通知自2020年10月1日起执行至2024年12月31日。适用政策的具体时间以《船舶所有权登记证书》的签发日期为准。
依据：
财政部 交通运输部 税务总局关于海南自由贸易港国际运输船舶有关增值税政策的通知
国家税务总局关于发布《国际运输船舶增值税退税管理办法》的公告
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