开行各分行签订的贷款合同实行按年汇总缴纳印花税的办法。即年度终了后1个月内，开行各分行向当地税务局申报缴纳印花税。同时向税务机关提供财政部《关于核定××××年度基本建设政策性财政贴息预算拨款的通知》和全年贷款合同明细表，经税务局对照核实后，对财政贴息的项目贷款合同免征印花税，其余非贴息贷款合同按规定缴纳印花税。
依据：
国家税务总局关于修改部分税收规范性文件的公告
国家税务总局关于明确国家开发银行分行营业账簿和贷款合同印花税缴纳方式的通知
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