同时取得综合所得和经营所得的纳税人，可在综合所得或经营所得中申报减除费用6万元、专项扣除、专项附加扣除以及依法确定的其他扣除，但不得重复申报减除。 出现这个提示是因为在经营所得年度报表中填写了相应的扣除，需要先更正申报经营所得年度报表，将“是否有综合所得”栏次选择“是”，然后再进行综合所得汇算清缴。
依据：
国家税务总局关于办理2021年度个人所得税综合所得汇算清缴事项的公告
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